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二代測(cè)序在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中的應(yīng)用

時(shí)間:2023-11-27 15:38:16   來(lái)源:互聯(lián)網(wǎng)

  在過(guò)去十年中,二代測(cè)序(NextGenerationSequencing,以下稱NGS)已從一種研究方法迅速發(fā)展成為標(biāo)準(zhǔn)臨床檢測(cè)的核心組成部分,世界衛(wèi)生組織血液腫瘤分類(第五版)、美國(guó)國(guó)立綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN V2023)等指南均把NGS列為重要的血液腫瘤檢測(cè)技術(shù)。在腫瘤學(xué)中,腫瘤NGS為檢測(cè)體細(xì)胞驅(qū)動(dòng)突變提供了一種關(guān)鍵工具,這些突變不僅表征了疾病,還影響了治療決策。而血液系統(tǒng)惡性腫瘤是一組生物學(xué)和臨床上多樣化的起源于造血細(xì)胞的腫瘤。與源自其他器官和組織的“實(shí)體瘤”相比,血液腫瘤歷來(lái)更適合快速采用新的診斷技術(shù)。我們將介紹二代測(cè)序在血液系統(tǒng)惡性腫瘤中的主要應(yīng)用:(1)疾病診斷(2)預(yù)后分層(3)靶向治療,以及(4)MRD監(jiān)測(cè)等。

  

  (1)疾病診斷:在部分血液系統(tǒng)惡性腫瘤中,同一基因在幾乎所有病例中都會(huì)反復(fù)發(fā)生突變。例如,Janus激酶2(JAK2)突變是真性紅細(xì)胞增多癥(PV)的一個(gè)決定性特征,PV是一種以外周血紅細(xì)胞增多癥為特征的骨髓增生性腫瘤。大約95%的PV病例在外顯子2中攜帶典型的JAK617p.Val14Phe突變,而其余病例基本上都以外顯子12中的多種框內(nèi)插入缺失為特征。因此,在紅細(xì)胞增多癥患者中,JAK2突變檢測(cè)具有巨大的診斷價(jià)值。即使沒(méi)有對(duì)外周血或骨髓進(jìn)行顯微鏡檢查,JAK2突變的鑒定也支持骨髓增生性腫瘤,并且由于JAK2突變?cè)赑V中基本上普遍存在,因此陰性結(jié)果強(qiáng)烈提示患者紅細(xì)胞增多癥的其他原因(例如,由于患者經(jīng)常發(fā)生的低氧血癥伴有基礎(chǔ)肺部疾病)。表中列舉部分血液腫瘤中具有診斷意義的基因突變,NGS檢測(cè)能夠精準(zhǔn)發(fā)現(xiàn)這些惡性血液腫瘤的驅(qū)動(dòng)突變,它為疾病診斷增加了客觀證據(jù)。

  

  (2)預(yù)后分層:除了提供診斷信息外,NGS還為血液系統(tǒng)惡性腫瘤的預(yù)后提供了價(jià)值。鑒于惡性血液腫瘤的侵襲性和結(jié)局的異質(zhì)性,風(fēng)險(xiǎn)分層在急性白血病中尤為重要。例如,有利的NGS結(jié)果包括bZIP結(jié)構(gòu)區(qū)基因CEBPA突變或NPM1突變。相比之下,ASXL1、RUNX1和TP53的突變以及FLT3內(nèi)部串聯(lián)重復(fù)突變均與不良預(yù)后相關(guān)。NGS發(fā)現(xiàn)致病性突變,可以對(duì)個(gè)體患者的化療/移植的治療效果、復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和預(yù)期生存率進(jìn)行更精細(xì)的預(yù)測(cè)。

  (3)靶向治療:在過(guò)去幾年中,一些突變靶向藥物已開(kāi)始在血液系統(tǒng)惡性腫瘤患者中顯示出希望。例如,F(xiàn)LT3突變AML的年輕患者現(xiàn)在常規(guī)接受替代誘導(dǎo)方案,包括FLT3抑制劑,如米多斯汀和吉替替尼。同樣,艾伏尼布和enasidenib已分別獲批用于治療IDH1和IDH2突變的AML患者。靶向藥物為一線治療失敗的患者提供了新的選擇,相信未來(lái)會(huì)出現(xiàn)更多更好的針對(duì)不同突變的靶向治療,而NGS檢測(cè)應(yīng)用是發(fā)現(xiàn)突變和輔助靶向治療的重要手段。

  (4)MRD監(jiān)測(cè):基于NGS的克隆型序列MRD檢測(cè)現(xiàn)已在多種惡性腫瘤中得到廣泛應(yīng)用。例如,在漿細(xì)胞骨髓瘤中,疾病進(jìn)展的風(fēng)險(xiǎn)與治療后殘留的病灶豐度高度相關(guān)。在過(guò)往研究中,患有MRD的骨髓瘤患者<10^−5平均進(jìn)展時(shí)間為80個(gè)月,而MRD>10^−3的患者為27個(gè)月。同樣,在B細(xì)胞ALL患兒中,基于NGS的MRD可預(yù)測(cè)復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)和生存率,其敏感性超過(guò)多參數(shù)流式細(xì)胞術(shù)的平均水平。

  總而言之,NGS已成為血液系統(tǒng)惡性腫瘤實(shí)驗(yàn)室評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)中不可或缺的工具。根據(jù)疾病的不同,突變數(shù)據(jù)可用于促進(jìn)診斷、告知預(yù)后、指導(dǎo)治療選擇或監(jiān)測(cè)疾病。將NGS突變數(shù)據(jù)整合到血液系統(tǒng)惡性腫瘤的當(dāng)前形態(tài)學(xué)、免疫表型和細(xì)胞遺傳學(xué)分析中,將增強(qiáng)我們對(duì)白血病發(fā)生的理解,并為患者提供更精度化的臨床服務(wù)。

  以上內(nèi)容僅作為科普內(nèi)容,具體病例及情況需要咨詢醫(yī)生。希望患友們?cè)缛湛祻?fù)、重獲新生。[作者:羅煜燊 審核:李迪]

  

  

  主要研究方向?yàn)榘籽∧退帣C(jī)制及腫瘤生物治療。在單倍體相合造血干細(xì)胞移植、惡性血液病的精準(zhǔn)診斷以及惡性腫瘤的分子靶向及免疫細(xì)胞治療方面造詣深厚。擅長(zhǎng)難治復(fù)發(fā)白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等惡性血液病的個(gè)體化免疫和分子靶向治療。承擔(dān)國(guó)家級(jí)、省市級(jí)科研項(xiàng)目20余項(xiàng);申請(qǐng)專利14項(xiàng),已授權(quán)國(guó)家發(fā)明專利10項(xiàng)、美國(guó)發(fā)明專利1項(xiàng);在國(guó)內(nèi)外期刊發(fā)表論文100多篇,其中Nature Nanotechnology、Nature Biomedica lEngineering、Proc Natl Acad Sci USA 等重要SCI雜志收錄60余篇;獲軍隊(duì)科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)1項(xiàng),廣東省科技進(jìn)步三等獎(jiǎng)1項(xiàng),廣東醫(yī)學(xué)科技二等獎(jiǎng)1項(xiàng),中國(guó)女醫(yī)師協(xié)會(huì)“五洲女子科技獎(jiǎng)”1項(xiàng),美國(guó)亞利桑那州立大學(xué)博士后科研獎(jiǎng)1項(xiàng)。

  【出診時(shí)間】

  每周一上午名醫(yī)門診(門診七樓)

  每周二上午血液科門診(門診二樓)

  

  南方醫(yī)科大學(xué)珠江醫(yī)院血液科檢驗(yàn)技師,實(shí)驗(yàn)室基因測(cè)序組組長(zhǎng)。負(fù)責(zé)血液腫瘤基因測(cè)序,擅長(zhǎng)髓系白血病、淋巴瘤、骨髓瘤等二代測(cè)序檢測(cè),在測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建、生物信息學(xué)分析和致病變異結(jié)果報(bào)告等方面經(jīng)驗(yàn)豐富。學(xué)術(shù)成果有以第一作者SCI論文1篇,共發(fā)4篇中科院二區(qū)或以上SCI論文。

(責(zé)任編輯:華康)

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